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<title>Ensembl</title>
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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">Ensembl</span></h1>
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<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr"><p><b>Ensembl</b> ist ein 1999 gestartetes <a href="Bioinformatik" title="Bioinformatik">bioinformatisches</a> Forschungsprojekt, das darauf abzielt „Software zu entwickeln, die automatisch Vermerke zum <a href="Eukaryotisch" class="mw-redirect" title="Eukaryotisch">eukaryotischen</a> <a href="Genom" title="Genom">Genom</a> anlegt und pflegt“. Es wird am <a href="European_Bioinformatics_Institute" title="European Bioinformatics Institute">European Bioinformatics Institute</a> (EBI) auf einem Außenposten des <a href="European_Molecular_Biology_Laboratory" class="mw-redirect" title="European Molecular Biology Laboratory">European Molecular Biology Laboratory</a> (EMBL) mit einem Team von rund 90 Personen betrieben.
</p><p>Alle Daten und die Software, die in diesem Projekt erzeugt werden, können von jedem eingesehen und genutzt werden. Der Upload sowie auch der Download von Daten ist möglich. Die meiste Software basiert auf <a href="Perl_(Programmiersprache)" title="Perl (Programmiersprache)">Perl</a> und der BioPerl-Infrastruktur.
</p><p>Eine stetig wachsende <a href="Liste_von_sequenzierten_Genomen" title="Liste von sequenzierten Genomen">Anzahl</a> von Genomen von Vertebraten und Modellorganismen können eingesehen und durchsucht werden. Unter anderem:
</p>
<ul><li><b>Chordaten</b>
<ul><li>Säugetiere: <a href="Mensch" title="Mensch">Mensch</a> (<i>Homo sapiens</i>), <a href="Gemeiner_Schimpanse" title="Gemeiner Schimpanse">Schimpanse</a> (<i>Pan troglodytes</i>), <a href="Rhesusaffe" title="Rhesusaffe">Rhesusaffe</a> (<i>Macaca mulatta</i>), <a href="Hausmaus" title="Hausmaus">Hausmaus</a> (<i>Mus musculus</i>), <a href="Wanderratte" title="Wanderratte">Wanderratte</a> (<i>Rattus norvegicus</i>), <a href="Haushund" title="Haushund">Haushund</a> (<i>Canis familiaris</i>), <a href="Rinder" title="Rinder">Rind</a> (<i>Bos taurus</i>), <a href="Afrikanischer_Elefant" title="Afrikanischer Elefant">Afrikanischer Elefant</a> (<i>Loxodonta africana</i>), <a href="Opossum" class="mw-redirect" title="Opossum">Opossum</a> (<i>Monodelphis domestica</i>)<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>, <a href="Braunbrustigel" title="Braunbrustigel">Braunbrustigel</a> (<i>Erinaceus europaeus</i>), <a href="Hauspferd" title="Hauspferd">Hauspferd</a> (<i>Equus caballus</i>)</li>
<li>Vögel: <a href="Haushuhn" title="Haushuhn">Haushuhn</a> (<i>Gallus gallus</i>)</li>
<li>Fische: <a href="Zebrab%C3%A4rbling" title="Zebrabärbling">Zebrabärbling</a> (<i>Danio rerio</i>), <a href="Fugu" title="Fugu">Fugu</a> (<i>Takifugu rubripes</i>), <a href="Gr%C3%BCner_Kugelfisch" title="Grüner Kugelfisch">Grüner Kugelfisch</a> (<i>Tetraodon nigroviridis</i>)</li>
<li>Seescheiden: <a href="Schlauchascidie" class="mw-redirect" title="Schlauchascidie">Schlauchascidie</a> (<i>Ciona intestinalis</i>), <i>Ciona savignyi</i></li></ul></li>
<li><b>Wirbellose</b>
<ul><li>Insekten: Taufliege <i><a href="Drosophila_melanogaster" title="Drosophila melanogaster">Drosophila melanogaster</a></i>, Moskito <i><a href="Anopheles_gambiae" title="Anopheles gambiae">Anopheles gambiae</a></i>, <a href="Honigbiene" class="mw-redirect" title="Honigbiene">Honigbiene</a> (<i>Apis mellifera</i>)</li>
<li>Fadenwürmer: <i><a href="Caenorhabditis_elegans" title="Caenorhabditis elegans">Caenorhabditis elegans</a></i></li></ul></li>
<li><b>Hefen</b>
<ul><li><a href="Bierhefe" class="mw-redirect" title="Bierhefe">Bierhefe</a> (<i>Saccharomyces cerevisiae</i>)</li></ul></li></ul>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Datenanzeige">Datenanzeige</h2></div>
<p>Auf der Eingangsseite der einzelnen Spezies findet der Anwender zunächst Statistiken, allgemeine Informationen über das <a href="Genom" title="Genom">Genom</a> und Neuigkeiten.
</p><p>Die Genkarte kann entweder durch einfaches Klicken auf einen <a href="Chromosom" title="Chromosom">Chromosomenabschnitt</a> oder durch manuelle Eingabe von Genmarkern aufgerufen werden.
Auf der Seite werden vier Teilabschnitte angezeigt:
</p>
<ul><li>das komplette <b><a href="Chromosom" title="Chromosom">Chromosom</a></b> mit hervorgehobenen Ausschnitt, der im Detail betrachtet wird</li>
<li><b>Overview</b>: Ein Überblick über eventuelle Syntänien (das Vorhandensein von Chromosomenbereichen mit den gleichen Genen in der gleichen Anordnung bei verschiedenen Spezies), Gene und Marker in der ausgewählten Region</li>
<li><b>Detailed View</b>: <a href="Gen" title="Gen">Gene</a>, <a href="MRNA" title="MRNA">mRNA</a>, <a href="Proteine" class="mw-redirect" title="Proteine">Proteine</a> etc. können hier eingesehen werden</li>
<li><b>Basepair View</b>: Anzeige der <a href="Nukleotidsequenz" title="Nukleotidsequenz">Nukleotidsequenz</a> mit ihren drei möglichen Leserastern und die daraus resultierenden <a href="Aminos%C3%A4uresequenz" title="Aminosäuresequenz">Aminosäuresequenzen</a></li></ul>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Suchfunktionen">Suchfunktionen</h2></div>
<ul><li><b>Stichwortsuche</b>: Mit <i>Search Ensembl</i> kann der Nutzer z. B. nach Genen, Markernamen, Proteinen, Krankheiten oder <a href="Syndrom" title="Syndrom">Syndromen</a> die bereitgestellten Genome durchsuchen.</li>
<li><b>BLAST</b>: Die <a href="BLAST-Algorithmus" title="BLAST-Algorithmus">BLAST</a>-Suchfunktion ermöglicht es, eine gegebene Nukleotid- oder Proteinsequenz mit der Datenbank zu vergleichen.</li>
<li><b>ExportView</b>: ExportView findet Genregionen anhand der Eingabe von Koordinaten.</li>
<li><b>Data mining (BioMart)</b>: Dieses Tool ermöglicht eine durch vielfältige Filtereinstellungen präzise Suche nach Genregionen.</li></ul>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>
<ul><li><a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ensembl.org">Ensembl-Seite</a></li>
<li><a rel="nofollow" class="external text" href="https://archive.ensembl.org">Archivierte Ensembl-Seiten (umfasst Datensätze seit Oktober 2004)</a></li></ul>
<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>
<ol class="references">
<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text"><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.ensembl.org/Monodelphis_domestica/Info/Index/">Monodelphis_domestica</a>, Ensembl genome browser 104</span>
</li>
</ol></div><!--htdig_noindex--><div><div class="zim-footer">
Dieser Artikel wurde von <a class="external text" title="Zuletzt bearbeitet am 2025-11-17" href="https://de.wikipedia.org/wiki/?title=Ensembl&oldid=261638165">Wikipedia</a> herausgegeben. Der Text ist unter <a class="external text" href="https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/deed.de">Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0</a> verfügbar, sofern nicht anders angegeben. Für die Mediendateien können zusätzliche Bedingungen gelten.
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